Después pasaría al Atlante FC en el Invierno ’01 y, tomando un segundo aire, alineó en los 18 encuentros de la temporada regular, llegando incluso a los cuartos de final de la liguilla por el título. La Pandilla no calificó a la Liguilla por el título en ninguno de los 4 torneos en los que Mohamed participó. En su primer torneo participó en los 17 encuentros del campeonato, anotando 4 goles y dando 5 pases para gol, siendo la primera vez en 5 torneos que no lideraba la liga en asistencias; para el Verano ’99 recuperaría el liderato de servicios a gol con 8 además de conseguir 7 goles.
